add exemplary parameters file

Author: oesteban

nipype/testing/data/epi_param.txt

@@ -0,0 +1,10 @@
+{
+    "enc_dir": "y-",
+    "echospacing": 7.800117313764398e-4,
+    "delta_te": 2.46e-3,
+    "epi_factor": 128,
+    "epi_lines": 57,
+    "epi_acc": 2,
+    "field_strength": 3.0,
+    "field_axis": "z"
+}

nipype/workflows/dmri/fsl/artifacts.py

@@ -555,20 +555,7 @@ def sdc_fmb(name='fmb_correction',
     """
 
     epi_defaults = {'delta_te': 2.46e-3, 'echospacing': 0.77e-3,
-                    'acc_factor': 3, 'enc_dir': u'AP'}
-
-    def _fix_enc_dir(enc_dir):
-        enc_dir = enc_dir.lower()
-        if enc_dir == 'lr':
-            return 'x-'
-        if enc_dir == 'rl':
-            return 'x'
-
-        if enc_dir == 'ap':
-            return 'y-'
-        if enc_dir == 'pa':
-            return 'y'
-        return enc_dir
+                    'acc_factor': 2, 'enc_dir': u'AP'}
 
     inputnode = pe.Node(niu.IdentityInterface(
         fields=['in_file', 'in_bval', 'in_mask', 'bmap_pha', 'bmap_mag',
@@ -875,6 +862,19 @@ def _eff_t_echo(echospacing, acc_factor):
     return eff_echo
 
 
+def _fix_enc_dir(enc_dir):
+    enc_dir = enc_dir.lower()
+    if enc_dir == 'lr':
+        return 'x-'
+    if enc_dir == 'rl':
+        return 'x'
+    if enc_dir == 'ap':
+        return 'y-'
+    if enc_dir == 'pa':
+        return 'y'
+    return enc_dir
+
+
 def _checkrnum(ref_num):
     from nipype.interfaces.base import isdefined
     if (ref_num is None) or not isdefined(ref_num):